A partir de 2027–2028, en España la factura electrónica pasa a ser obligación en B2B (y en LATAM depende del país: por ejemplo, México ya va con CFDI).
Si aún facturas en Word, Excel o PDF “a pelo” (sin un sistema homologado detrás), puedes estar yendo derechito hacia un lío: errores, facturas no válidas en ciertos casos y sanción si estás obligado.
La Ley 56/2007 (art. 2 bis § 9) y la Ley Crea y Crece establecen que las empresas obligadas que no ofrezcan factura electrónica podrán recibir «una multa de hasta 10 000 euros».
Y es que cada vez más negocios están pasando a software de facturación que unifica CRM, presupuestos, firma y facturas legales, porque lo de “venga, te mando el PDF” ya no aguanta el tirón cuando hay normativa y control.
El problema: muchos CRM dicen que “incluyen facturación”, pero se quedan cortos. O tiran de integraciones de terceros, o no dejan trazabilidad real, o no cumplen lo que pide Hacienda/SAT en formatos y registros.
Antes de empezar… ¿qué tiene que tener un buen programa de facturación electrónica?
- Sistema de facturación conforme a SIF (registro, trazabilidad, huella/hash y control anti-manipulación).
- Formato fiscal real según país: Facturae cuando aplique (España), CFDI 4.0 (México), y lo equivalente en tu país.
- Firma / validación legal según el caso: firma electrónica cuando sea necesaria en tu flujo, y en México timbrado CFDI (que es lo que la hace válida).
- Código QR y mención VERI*FACTU cuando aplique esa modalidad en España.
- Envío/Comunicación a la autoridad cuando aplique (AEAT en España según el sistema; SAT en México vía timbrado), o custodia/registro interno conforme a lo exigido.
- Registro de emisión/anulación y trazabilidad completa, y si estás en sistemas con plazos (por ejemplo SII), cumplimiento de tiempos legales.
- Histórico y copias de seguridad durante el mínimo fiscal (habitualmente 4 años).
Si tu CRM no cubre lo que aplica a tu país y a tu caso, tu “factura” puede quedarse en un PDF bonito para cobrar, pero no en una factura legal.
Te dejo una comparativa clara de lo que hacen los CRM que dicen que tienen “factura electrónica”. ¿Empezamos?

¿Qué puede hacer un CRM con facturación electrónica?
Vamos a hablar del proceso habitual de emitir facturas.
El de toda la vida, el que hacen muchas pymes, agencias y autónomos:
Vendes → abres Word o Excel → copias datos del cliente → montas la factura a mano → la exportas en PDF → la mandas por email → apuntas en otro sitio si te han pagado o no.
Y si quieres añadir firma o trazabilidad, toca abrir otra herramienta, y si hay cambios… a empezar otra vez.
Todo esto consume tiempo, se presta a errores y, si ya te aplica la obligación o tu sector lo exige, puedes quedarte corto frente a la normativa.
Con un CRM que de verdad tiene la facturación integrada, todo ese proceso se resume a esto:
- Creas el presupuesto desde el CRM, con los datos del cliente ya cargados.
- Te lo aceptan → lo conviertes en factura con un clic.
- Si lo necesitas, la firmas electrónicamente sin salir de la plataforma.
- La envías por email y queda registro del envío y del estado.
- Haces seguimiento del pago desde el mismo sitio donde gestionas tus ventas.
Y todo, cumpliendo con los requisitos fiscales que ya están en vigor (o a punto de estarlo).
Y todo (x2) automatizado con flujos preconfigurados.
No hay duplicación de tareas, no hay archivos sueltos y no dependes de herramientas externas para algo tan básico como cobrar bien y con seguridad.
Comparativa de los 6 mejores CRM con facturación electrónica
No todos los CRM que dicen tener “facturación electrónica” están de verdad preparados para lo que viene: automatización real, firma legal, y cumplimiento con normativas como Verifactu o eIDAS.
En esta tabla vas a encontrar una comparativa clara entre las plataformas más conocidas. Algunas están pensadas para pymes y agencias que quieren todo listo desde el primer día.
Otras requieren configuraciones técnicas, integraciones de terceros o directamente no cumplen con la ley.
Revisa bien cada columna: legalidad, firma electrónica, facilidad de uso y, sobre todo, si cumplen con las normativas en España y LATAM.
1- Clientify – CRM con facturación electrónica gratis
Clientify es un CRM con facturación gratuíta pensada para pymes y agencias que no quieren complicarse mucho conectando herramientas.
Viene con todo el proceso comercial ya montado y obviamente, con factura electrónica: desde el primer contacto con el cliente hasta el cobro de la factura.
No necesitas tocar código, ni integrar software externo, ni pelearte con formatos legales.
Lo he testado internamente durante varios meses y ya he podido emitir más de 50 facturas sin incidencias.
Además, está adaptado a la normativa fiscal de España (Verifactu, ticketbai, firma eIDAS) y para equipos que quieren eficiencia, control y cumplimiento legal, es una de las opciones más completas que hay ahora mismo.
La factura electrónica de Clientify es 100% compliance y gratuíta (100 facturas al año) con un CRM de regalo ¿Qué más pedir?
Lo bueno:
- Tiene todo el flujo completo: presupuesto → firma → factura legal → seguimiento.
- Cumple normativa fiscal española y LATAM sin configuraciones extra.
- Interfaz sencilla y soporte directo en español.
- Tiene todo lo que tu empresa necesita en cuanto a ventas, marketing y comunicación.
- Gratis 100 facturas al año.
Lo malo:
- No está pensada para corporativos o empresas con flujos internos ultra personalizados.
2- Odoo
Odoo es una plataforma gigante, más un ERP modular que un CRM puro.
Tiene de todo: contabilidad, stock, proyectos, ventas, RRHH… y sí, también incluye facturación electrónica legal si activas los módulos adecuados.
Pero esa es la cosa: hay que saber qué módulos activar, cómo configurarlos y muchas veces tocar código o contratar un partner. No es una herramienta que abras y uses, pero es un ERP con facturaE muy potente si sabes donde tocar.
Si tu empresa ya trabaja con Odoo o tienes un equipo técnico detrás, es una opción potente…
Pero para una pyme o agencia que solo quiere tener el proceso de venta y facturación controlado, se queda excesivamente compleja, o al menos esa ha sido mi sensación.
Lo bueno:
- Cumple con formatos legales como FacturaE si se configura bien.
- Puedes tener todo el ecosistema empresarial centralizado en un solo software.
- Es escalable y altamente personalizable.
Lo malo:
- La curva de aprendizaje es alta si no tienes perfil técnico o consultoría.
- No trae firma de documentos (presupuestos/contratos) por defecto; suele requerir módulo/app adicional. Para FacturaE, necesitas la localización/módulo y cargar certificado
- El flujo de ventas → factura no es tan intuitivo ni directo como en otros CRM más ligeros.
Hemos preparado una comparativa extensa entre Odoo y Clientify, échale un vistazo.
3- Zoho
Zoho tiene un ecosistema inmenso de herramientas, su CRM es conocido por ser modular, flexible y relativamente fácil de usar.
En cuanto a facturación, puedes combinar Zoho CRM con Zoho Books o Zoho Invoice para emitir presupuestos y facturas, incluso firmarlas con Zoho Sign.
Zoho Invoice es gratis; Zoho Books es de pago (con prueba).
El problema aparece cuando hablamos de cumplimiento legal en España o LATAM: en países como México funciona bien con CFDI. En España, Zoho puede cumplir VeriFactu, pero no ‘solo’: en Zoho Invoice necesitas sí o sí B2Brouter para conectarlo con AEAT.s.
Si ya usas otros productos de Zoho, tiene sentido integrarlo todo, pero si vienes buscando solo un CRM que facture legal y sin complicaciones… te vas a encontrar con limitaciones.
Lo bueno:
- Ecosistema completo: CRM + facturación + firma, todo dentro de Zoho.
- Facilidad de uso y buena documentación en español.
- Plan gratuito para empezar con facturación básica.
Lo malo:
- En España no cumple todavía con la normativa Verifactu sin ayuda externa.
- La integración entre Zoho CRM y Zoho Books requiere ajustes manuales.
- Algunas funciones clave (firma, automatización, informes) están limitadas a los planes más altos.
Puedes ver la comparativa entre Zoho CRM y Clientify.
4- Salesforce
Salesforce es una bestia pensada para grandes empresas. Su CRM es de lo más potente que hay, pero eso también significa complejidad y coste.
Si hablamos de facturación electrónica, Salesforce no lo resuelve de forma nativa. Necesitas módulos como CPQ + Billing o herramientas externas como JustOn para poder emitir facturas adaptadas a normativa fiscal.
Y ni con eso está preparado directamente para cumplir Verifactu o emitir FacturaE en España.
Es una plataforma pensada para procesos complejos, grandes equipos, y estructuras personalizadas.
Si tienes equipo técnico o trabajas con partners certificados, se puede montar algo potente… pero desde luego no es para una pyme que quiere facturar legal y rápido.
Lo bueno:
- Extremadamente personalizable y escalable.
- Flujo de ventas a facturación completo con CPQ + Billing (bien montado).
- Ideal para empresas grandes que ya trabajan con Salesforce.
Lo malo:
- No emite facturas legales adaptadas a España o LATAM sin ayuda externa.
- Necesitas módulos caros y configuración técnica avanzada.
- El coste de licencia y setup lo hace inviable para la mayoría de pymes.
Como no, aquí tienes una comparativa extensa entre Salesforce y Clientify.
5- HubSpot
HubSpot es uno de los CRM más populares para marketing y ventas, sobre todo por su facilidad de uso y por lo bien que funciona para generar oportunidades.
El problema es que, aunque tiene herramientas para enviar presupuestos (quotes) y hacer cobros, no está pensado para facturación electrónica legal.
HubSpot factura y cobra, sí. Pero para FacturaE/VeriFactu/CFDI y cumplimiento fiscal ‘duro’, necesitas herramienta externa o integración
Pero si buscas centralizar todo el proceso de venta y facturación legal, te obliga a usar herramientas externas como Quaderno o Holded, y eso ya es otro lío.
Lo bueno:
- Muy fácil de usar, interfaz limpia y rápida curva de aprendizaje.
- Buen sistema de presupuestos y flujos de venta.
- Integración con muchas herramientas externas.
Lo malo:
- No permite emitir facturas legales válidas según Hacienda o SAT.
- No tiene firma electrónica integrada ni cumplimiento fiscal.
- Si quieres usarlo para facturar bien, necesitas varias herramientas externas (y pagarlas).
6- HighLevel
HighLevel está pensado sobre todo para agencias de marketing y freelancers técnicos.
Es una herramienta muy potente en automatización: puedes montar funnels, secuencias de WhatsApp, workflows de cobro y más… pero no está preparada para cumplir con la normativa de facturación electrónica en España o LATAM.
La función de facturación existe, sí, pero es básica: genera documentos para cobrar, no facturas legales con firma, numeración fiscal ni formatos como FacturaE o CFDI.
Tiene facturas para cobrar, pero no está orientado a e-invoicing fiscal (FacturaE/VeriFactu/CFDI) y normalmente necesitarás software externo para cumplir
Además, todo está orientado al mercado estadounidense. Si eres una agencia y te manejas bien con flujos automáticos y no necesitas cumplir una normativa específica, puede servir.
Si necesitas emitir facturas legales, olvídate por ahora.
Lo bueno:
- Muy buena para automatizar flujos de cobro y envío de presupuestos.
- Todo está en un solo sitio: CRM, landing pages, cobros, automatizaciones.
- Precio cerrado por cuenta de agencia, sin límite de usuarios.
Lo malo:
- No emite facturas legales adaptadas a España o LATAM.
- No tiene firma electrónica ni cumplimiento fiscal.
- La interfaz es algo técnica y no está en español.
Te dejo aquí una comparativa desarrollada entre HighLevel y Clientify
| CRM / Funcionalidad | Factura legal (FacturaE/CFDI) | Firma eIDAS/SAT integrada | Verifactu/TicketBAI compliant | Flujo presup.→factura | Precio aprox. (plan base) |
|---|---|---|---|---|---|
| Clientify | ✅ Sí (FacturaE 3.2.2, CFDI 4.0) | ✅ Sí (incluida) | ✅ Sí (QR y sello en factura) | ✅ 1 clic (desde oportunidad) | GRATIS hasta 100 facturas al año |
| Odoo | ✅ Sí (módulos FacturaE/TicketBAI) | ✖ Por defecto (necesita extras) | ✅ Sí (TicketBAI integrado) | ⚠️ Parcial (requiere configuración compleja) | De 0 (Community) + consultoría |
| Zoho CRM + Books/Invoice | ⚠️ Con Zoho Invoice + B2BRouter | ✖ Zoho CRM solo no | ✅ Sí (a través de B2BRouter) | ⚠️ Fragmentado (CRM + módulo facturación) | Desde ~12 $/mes (CRM) + extra |
| Salesforce (CPQ+Billing) | ⚠️ Con add-ons (no nativo) | ✖ No (sin módulos extra) | ✖ No (hay que montar vía partner) | ⚠️ Sí (con CPQ+Billing) | Muy alto (licencias + partners) |
| HubSpot | ✖ No (solo PDFs de marketing) | ✖ No | ✖ No | ⚠️ Sí (quotes básicos) | Gratis o ~50 $/mes (Starter) |
| HighLevel | ✖ No (función muy básica) | ✖ No | ✖ No | ✅ Sí (automatizaciones US) | 297 $/mes (agencia, usuarios ilimit.) |
Preguntas frecuentes – CRM con facturación electrónica
1. ¿Qué es un CRM con facturación electrónica?
Es un software que te permite gestionar clientes y ventas, y también emitir facturas legales desde la misma plataforma, sin usar otras herramientas externas.
2. ¿Un CRM puede emitir facturas válidas ante Hacienda o SAT?
Depende del CRM. Algunos están adaptados a la normativa (como Verifactu en España o CFDI en México) y otros solo generan facturas informativas que no son válidas legalmente.
3. ¿Qué CRM emiten facturas legales en España con Verifactu y TicketBAI?
Actualmente, CRMs como Clientify y Odoo están adaptados a la normativa española. Otros como HighLevel no cumplen los requisitos legales.
4. ¿Necesito firma electrónica en mis facturas para que sean válidas?
Sí, si estás emitiendo facturas electrónicas en España o LATAM, deben estar firmadas digitalmente según la normativa de cada país (eIDAS, SAT, etc.).
5. ¿Qué diferencia hay entre una factura electrónica y una factura normal en PDF?
Una factura electrónica válida incluye firma digital, trazabilidad, estructura fiscal correcta y, en algunos casos, código QR o validación ante Hacienda, un PDF no firmado no es suficiente.
6. ¿Puedo automatizar todo el proceso de venta hasta la factura en un CRM?
Sí, si el CRM está bien integrado. Por ejemplo, en Clientify puedes crear un lead, enviar un presupuesto, firmarlo y emitir la factura legal sin salir de la herramienta.
7. ¿Qué pasa si mi CRM no está adaptado a la ley Verifactu?
A partir de 2026 puedes recibir sanciones si no emites facturas según esta normativa en España.
8. ¿Un CRM puede sustituir a un software de facturación tipo Quipu o Holded?
Sí, si el CRM incluye funciones de facturación legal, firma electrónica y control de pagos, puede sustituir perfectamente a un software externo.
9. ¿Qué CRM con facturación electrónica son más fáciles de usar?
Clientify y Zoho destacan por su simplicidad. Odoo y Salesforce también tienen opciones, pero requieren conocimientos técnicos o configuración avanzada.
10. ¿En qué consiste la normativa Verifactu y TicketBAI?
Verifactu es una normativa española que exige, a partir de 2026, que todas las facturas electrónicas generadas por software incluyan registro automático, trazabilidad, código QR y sello digital. Está orientada a combatir el fraude fiscal y garantizar transparencia total.
TicketBAI es la norma de control de facturación que las tres Haciendas Forales vascas (Álava, Bizkaia y Gipuzkoa) han creado, junto con el Gobierno Vasco, para cerrar la puerta al fraude de IVA y de IRPF.
Si vendes y facturas por separado, estás perdiendo tiempo y te estás complicando más de la cuenta. Y con las nuevas normativas, además, te la estás jugando.
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